Одновременно со взрывом атомной бомбы поблизости от эпицентра возникали пожары, распространявшиеся на обширные территории. Через несколько часов после взрыва на расстоянии 2,4 километров от места взрыва, у станции Нагасаки и в Префектуральном управлении, что в 3,3 километрах от эпицентра, от тления вспыхнули пожары, охватившие впоследствии весь город. Площадь в 6,7 квадратных километров, что составляло одну треть города, была полностью сожжена. Число уничтоженных или частично сгоревших кварталов достигало 79.